Pada fase 3 ini, INOVASI berfokus pada menjembatani kesenjangan antara kebijakan nasional dan pelaksanaannya di tingkat kabupaten/kota dan sekolah, serta memperkuat ekosistem pendidikan di tingkat kabupaten/kota. Harapannya pada 2031, Indonesia memiliki dan menerapkan kebijakan serta mempraktikkan pendidikan inklusif yang berdampak pada peningkatan keterampilan dasar bagi semua siswa sekolah dasar, termasuk anak‑anak penyandang disabilitas.